Quantitative analysis of chromatin interaction changes upon a 4.3 Mb deletion at mouse 4E2

Circular chromosome conformation capture (4C) has provided important insights into three dimensional (3D) genome organization and its critical impact on the regulation of gene expression. We developed a new quantitative framework based on polymer physics for the analysis of paired-end sequencing 4C...

Ausführliche Beschreibung

Bibliographische Detailangaben

Hauptverfasser:	Zepeda-Mendoza, Cinthya J. (VerfasserIn) , Mukhopadhyay, Swagatam (VerfasserIn) , Wong, Emily S. (VerfasserIn) , Harder, Nathalie (VerfasserIn) , Splinter, Erik (VerfasserIn) , de Wit, Elzo (VerfasserIn) , Eckersley-Maslin, Melanie A. (VerfasserIn) , Ried, Thomas (VerfasserIn) , Eils, Roland (VerfasserIn) , Rohr, Karl (VerfasserIn) , Mills, Alea (VerfasserIn) , de Laat, Wouter (VerfasserIn) , Flicek, Paul (VerfasserIn) , Sengupta, Anirvan M. (VerfasserIn) , Spector, David L. (VerfasserIn)
Dokumenttyp:	Article (Journal)
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	21 November 2015
In:	BMC genomics Year: 2015, Jahrgang: 16, Heft: 1, Pages: 1-17
ISSN:	1471-2164
DOI:	10.1186/s12864-015-2137-5
Online-Zugang:	Verlag, lizenzpflichtig, Volltext: https://doi.org/10.1186/s12864-015-2137-5
Verfasserangaben:	Cinthya J. Zepeda-Mendoza, Swagatam Mukhopadhyay, Emily S. Wong, Nathalie Harder, Erik Splinter, Elzo de Wit, Melanie A. Eckersley-Maslin, Thomas Ried, Roland Eils, Karl Rohr, Alea Mills, Wouter de Laat, Paul Flicek, Anirvan M. Sengupta & David L. Spector