Genomic variations and epigenomic landscape of the medaka inbred Kiyosu-Karlsruhe (MIKK) panel

The teleost medaka (Oryzias latipes) is a well-established vertebrate model system, with a long history of genetic research, and multiple high-quality reference genomes available for several inbred strains. Medaka has a high tolerance to inbreeding from the wild, thus allowing one to establish inbre...

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: Leger, Adrien (VerfasserIn) , Brettell, Ian (VerfasserIn) , Monahan, Jack (VerfasserIn) , Barton, Carl (VerfasserIn) , Wolf, Nadeshda (VerfasserIn) , Kusminski, Natalja (VerfasserIn) , Herder, Cathrin (VerfasserIn) , Aadepu, Narendar (VerfasserIn) , Becker, Clara (VerfasserIn) , Gierten, Jakob (VerfasserIn) , Hammouda, Omar T. (VerfasserIn) , Hasel, Eva (VerfasserIn) , Lischik, Colin (VerfasserIn) , Lust, Katharina (VerfasserIn) , Sokolova, Natalia (VerfasserIn) , Suzuki, Risa (VerfasserIn) , Tavhelidse-Suck, Tinatini (VerfasserIn) , Thumberger, Thomas (VerfasserIn) , Tsingos, Erika (VerfasserIn) , Watson, Philip (VerfasserIn) , Welz, Bettina (VerfasserIn) , Naruse, Kiyoshi (VerfasserIn) , Loosli, Felix (VerfasserIn) , Wittbrodt, Joachim (VerfasserIn) , Birney, Ewan (VerfasserIn) , Fitzgerald, Tomas (VerfasserIn)
Dokumenttyp: Article (Journal)
Sprache:Englisch
Veröffentlicht: 21 February 2022
In: Genome biology
Year: 2022, Jahrgang: 23, Pages: 1-24
ISSN:1474-760X
DOI:10.1186/s13059-022-02602-4
Online-Zugang:Verlag, lizenzpflichtig, Volltext: https://doi.org/10.1186/s13059-022-02602-4
Volltext
Verfasserangaben:Adrien Leger, Ian Brettell, Jack Monahan, Carl Barton, Nadeshda Wolf, Natalja Kusminski, Cathrin Herder, Narendar Aadepu, Clara Becker, Jakob Gierten, Omar T. Hammouda, Eva Hasel, Colin Lischik, Katharina Lust, Natalia Sokolova, Risa Suzuki, Tinatini Tavhelidse, Thomas Thumberger, Erika Tsingos, Philip Watson, Bettina Welz, Kiyoshi Naruse, Felix Loosli, Joachim Wittbrodt, Ewan Birney and Tomas Fitzgerald
Beschreibung
Zusammenfassung:The teleost medaka (Oryzias latipes) is a well-established vertebrate model system, with a long history of genetic research, and multiple high-quality reference genomes available for several inbred strains. Medaka has a high tolerance to inbreeding from the wild, thus allowing one to establish inbred lines from wild founder individuals.
Beschreibung:Gesehen am 03.05.2022
Beschreibung:Online Resource
ISSN:1474-760X
DOI:10.1186/s13059-022-02602-4